马蒂亚斯·穆勒毕业于瑞士巴塞尔大学音乐学院，从师于汉斯·鲁道夫·斯大德和J·伯格·怀滕巴赫。穆勒自1996年以来一直定居在苏黎世，任苏黎世艺术大学（ZHDK）单簧管教授。

他是一位多才多艺的艺术家，在各个机构和各个项目中担任艺术总监、作曲家和教师。他以独奏者的身份与苏黎世唐霍尔管弦乐队、莫斯科柴可夫斯基交响乐团、米兰交响乐团等著名管弦乐队一起演出。他支持新音乐的创作，并参加了100多场首演。

在苏黎世艺术大学（ZHDK）的计算机音乐和声音技术研究所，他负责“传感器增强低音单簧管”的研究项目，这是一种可以按常规方式播放但也可以由计算机控制的仪器。

作为一名作曲家，他遵循了 “第二现代主义美学”的发展路线，并试图一次又一次地以跨学科的方式贯彻下去。除了音乐剧院和管弦乐队的作品，他的作品还包括许多室内乐和电子音乐。他为单簧管写了一部教学作品，并继续定期为儿童创作作品。